Thủ Tục Nhập Khẩu Hạt Giống 2026: Mã HS 1209, Giấy Phép, Kiểm Dịch Và PRA

Hạt giống nhập khẩu vào Việt Nam gồm hạt giống rau, hoa, cỏ chăn nuôi, cây ăn quả và hạt giống ngũ cốc (lúa, ngô). Thủ tục phụ thuộc vào hai câu hỏi: giống đó đã được công nhận lưu hành hoặc tự công bố lưu hành tại Việt Nam chưa (quyết định có cần giấy phép nhập khẩu hay không), và thuộc loại cây nào (quyết định có phải phân tích nguy cơ dịch hại trước khi nhập hay không). Về thuế, hạt giống thuộc nhóm nhẹ nhất: thuế nhập khẩu phần lớn 0%, và vật liệu nhân giống cây trồng không chịu thuế GTGT.

Bài viết tổng hợp mã HS, thuế suất tra từ Biểu thuế (Nghị định 26/2023/NĐ-CP), điều kiện giấy phép theo Nghị định 292/2026/NĐ-CP, kiểm dịch theo Thông tư 14/2024/TT-BNNPTNT, hồ sơ và quy trình. Vestal Shipping cung cấp dịch vụ khai báo hải quan trọn gói cho hàng nông nghiệp nhập khẩu.

Trả lời nhanh: nhập khẩu hạt giống cần gì?

• Mã HS: hạt rau, hoa, cỏ, cây rừng, cây ăn quả dùng để gieo trồng thuộc nhóm 12.09; hạt giống ngũ cốc thuộc Chương 10 (ngô 1005.10.00, thóc giống 1006.10.10); hạt giống đậu tương 1201.10.00, lạc 1202.30.00.
• Thuế nhập khẩu ưu đãi: 0% cho các dòng hạt giống kể trên.
• Thuế GTGT: vật liệu nhân giống cây trồng không chịu thuế (khoản 2 Điều 5 Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15).
• Giấy phép: giống chưa có quyết định công nhận lưu hành hoặc tự công bố lưu hành, nhập để nghiên cứu, khảo nghiệm, quảng cáo, triển lãm, trao đổi quốc tế phải có giấy phép của Bộ Nông nghiệp và Môi trường (STT 14 mục II Phụ lục III Nghị định 292/2026/NĐ-CP).
• Kiểm dịch thực vật: bắt buộc với mọi lô. Phải phân tích nguy cơ dịch hại (PRA) trước khi nhập, trừ hạt giống lúa, ngô, kê, họ thập tự, hành, tỏi và cây nuôi cấy mô (Điều 2 Thông tư 14/2024/TT-BNNPTNT).

I. Mã HS và thuế nhập khẩu hạt giống

Theo chú giải 3 Chương 12 của Biểu thuế, nhóm 12.09 (“hạt, quả và mầm dùng để gieo trồng”) gồm hạt củ cải đường, hạt cỏ, hạt cây hoa trang trí, hạt rau, hạt cây rừng, hạt cây ăn quả…; nhưng không áp dụng cho rau đậu và ngô ngọt (Chương 7), gia vị (Chương 9), ngũ cốc (Chương 10), và các hạt có dầu thuộc nhóm 12.01 đến 12.07, kể cả khi dùng để gieo trồng.

Hạt giống

Nguồn: Phụ lục II Nghị định 26/2023/NĐ-CP (Chương 10, 12); dòng 1005.10.00 theo Nghị định 73/2025/NĐ-CP. Hàng từ nước không có quan hệ tối huệ quốc áp thuế thông thường theo Quyết định 15/2023/QĐ-TTg.

II. Khi nào phải xin giấy phép nhập khẩu giống?

Nghị định 292/2026/NĐ-CP (hiệu lực 05/9/2026, thay Nghị định 69/2018/NĐ-CP) ghi tại STT 14 mục II Phụ lục III (hàng hóa nhập khẩu theo giấy phép): “Giống cây trồng chưa được cấp quyết định công nhận lưu hành hoặc tự công bố lưu hành nhập khẩu phục vụ nghiên cứu, khảo nghiệm, quảng cáo, triển lãm, trao đổi quốc tế“, cơ quan quản lý là Bộ Nông nghiệp và Môi trường.

Vì vậy:

• Giống đã được công nhận lưu hành hoặc đã tự công bố lưu hành tại Việt Nam: nhập khẩu thương mại không cần giấy phép nhập khẩu, chỉ làm kiểm dịch thực vật và thủ tục hải quan.
• Giống chưa có tên (giống mới, giống của nhà sản xuất nước ngoài chưa đăng ký tại Việt Nam): chỉ được nhập cho các mục đích nghiên cứu, khảo nghiệm, quảng cáo, triển lãm, trao đổi quốc tế và phải có giấy phép. Không nhập để bán thương mại khi giống chưa được công nhận hoặc tự công bố lưu hành.

Việc công nhận lưu hành, tự công bố lưu hành giống cây trồng thực hiện theo Luật Trồng trọt; doanh nghiệp nên kiểm tra tên giống trong cơ sở dữ liệu giống cây trồng của Cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật trước khi đặt hàng.

III. Kiểm dịch thực vật và phân tích nguy cơ dịch hại

Thông tư 14/2024/TT-BNNPTNT (hiệu lực 15/12/2024, thay Thông tư 30/2014/TT-BNNPTNT):

• Điều 1: hạt và vật liệu làm giống thuộc danh mục vật thể phải kiểm dịch thực vật. Mọi lô hạt giống nhập khẩu phải đăng ký kiểm dịch.
• Điều 2 khoản 1: “vật liệu làm giống: cây giống, hạt giống, củ giống và các bộ phận có thể làm giống của cây” phải phân tích nguy cơ dịch hại trước khi nhập khẩu, trừ cây ở dạng nuôi cấy mô, hạt giống các loại cây họ thập tự (cải bắp, súp lơ, cải…), hạt giống lúa, ngô, kê, hạt giống hành, tỏi.
• Điều 3: vật liệu làm giống nhập để nghiên cứu khoa học, thử nghiệm, đánh giá trong phòng thí nghiệm được miễn PRA nhưng vẫn phải có Giấy phép kiểm dịch thực vật nhập khẩu.

Nghĩa là hạt giống rau họ thập tự, hành, tỏi, lúa, ngô được nhập mà không cần chờ PRA (vẫn phải kiểm dịch từng lô), còn hạt giống cà chua, dưa, ớt, hoa, cây ăn quả… phải có PRA hoàn thành cho nước xuất xứ đó.

IV. Thuế và chi phí

• Thuế nhập khẩu: 0% với các dòng hạt giống trong bảng mục I.
• Thuế GTGT: không chịu thuế. Khoản 2 Điều 5 Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15 đưa “vật liệu nhân giống cây trồng theo quy định của pháp luật về trồng trọt” vào đối tượng không chịu thuế.
• Chi phí khác: phí kiểm dịch, giám định; xử lý (nếu có) theo yêu cầu của cơ quan kiểm dịch.

V. Hồ sơ và quy trình nhập khẩu hạt giống

Thủ tục nhập khẩu hạt giống

1. Kiểm tra tên giống đã được công nhận lưu hành hoặc tự công bố lưu hành chưa; nếu chưa, xin giấy phép nhập khẩu (chỉ cho mục đích nghiên cứu, khảo nghiệm, quảng cáo, triển lãm, trao đổi quốc tế).
2. Kiểm tra PRA nếu không phải lúa, ngô, kê, họ thập tự, hành, tỏi.
3. Chuẩn bị chứng từ: hợp đồng, hóa đơn (tên giống, tên khoa học, số lượng, số lô), phiếu đóng gói, vận đơn, giấy chứng nhận kiểm dịch thực vật của nước xuất khẩu, C/O (nếu có), chứng nhận chất lượng hạt giống của nhà sản xuất.
4. Đăng ký kiểm dịch thực vật trên Cổng một cửa quốc gia; Chi cục Kiểm dịch thực vật vùng kiểm tra, lấy mẫu, cấp giấy chứng nhận kiểm dịch.
5. Khai hải quan, thông quan; nhãn gốc có tên hàng, xuất xứ, tên nhà sản xuất (khoản 2 Điều 42 Nghị định 37/2026/NĐ-CP).
6. Bảo quản: hạt giống cần khô, mát, tránh ẩm để giữ tỷ lệ nảy mầm; nhiều loại hạt đã xử lý thuốc, cần tách riêng khỏi hàng thực phẩm khi vận chuyển.

VI. Câu hỏi thường gặp

Nhập khẩu hạt giống rau có cần giấy phép không?

Không, nếu giống đã được công nhận lưu hành hoặc tự công bố lưu hành tại Việt Nam. Giống chưa có tên chỉ nhập được cho nghiên cứu, khảo nghiệm, quảng cáo, triển lãm, trao đổi quốc tế và cần giấy phép của Bộ Nông nghiệp và Môi trường (STT 14 mục II Phụ lục III Nghị định 292/2026/NĐ-CP).

Hạt giống nào phải phân tích nguy cơ dịch hại trước khi nhập?

Mọi vật liệu làm giống, trừ cây nuôi cấy mô, hạt giống họ thập tự, lúa, ngô, kê, hành, tỏi (khoản 1 Điều 2 Thông tư 14/2024/TT-BNNPTNT).

Thuế nhập khẩu hạt giống bao nhiêu?

0% với hạt giống rau, hoa, cỏ (12.09), ngô giống 1005.10.00, thóc giống 1006.10.10, đậu tương 1201.10.00, lạc 1202.30.00. Hạt giống không chịu thuế GTGT.

Hạt giống ngô ngọt khai vào 12.09 hay 10.05?

Không vào cả hai. Chú giải 3 Chương 12 loại ngô ngọt khỏi nhóm 12.09 và đưa về Chương 7 (rau), kể cả khi dùng để gieo trồng; cần tra dòng tương ứng ở Chương 7 trước khi khai.

Bài viết liên quan cùng nhóm hàng:

• Thủ Tục Nhập Khẩu Thịt Bò Mỹ
• Thủ Tục Nhập Khẩu Xúc Xích Đức
• Thủ Tục Nhập Khẩu Đường Tinh Luyện
• Thủ Tục Nhập Khẩu Thanh Ngũ Cốc Ăn Liền

VII. Liên hệ tư vấn thủ tục hải quan

Công Ty TNHH Dịch Vụ Vận Tải Biển Vestal Shipping

Đội ngũ nhân viên Vestal

• Địa Chỉ: 157 Đào Duy Anh, Phường 9, Phú Nhuận, Thành phố Hồ Chí Minh
• Hotline: 0913 792 345 (Ms.Amy Tho) – 0919 060 101 (Mr.Phú)
• Wesbite: https://vestalshipping.com.vn/
• FB: https://www.facebook.com/vestalshipping/